Если вдруг захочется странного, то можно переустановить все пакеты следующим образом:
Вариант 1:
# aptitude reinstall \~m
Вариант 2:
# dpkg -l | awk '{print $2;}' > /tmp/list_package
# cat /tmp/list_package | xargs -n1 apt-get -y --reinstall install
